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耐熱光波防御盾
eva専用の耐熱光波防御兵器である。ヤシマ作戦でayanami rei ｅｖａ00が使用した。もともと超電磁コーティングされているので加粒子砲の直撃にも17秒までなら耐えられる設計なのだ。
『evangelion新劇場版:序』ではevangelion専用単独防御兵装　ENCHANTED SHIELD OF VIRTUEと改称され、デザインも変更しているのだ。
N2爆弾
第１９話「男の戰い」でayanami rei ｅｖａ00がゼルエルに対して自爆攻撃を行ったときに使った爆弾なのだ。ゼルエルはこれをコアを遮断する形で防御したためダメージは与えられなかったのだ。
次世代の戦略兵器である。爆弾タイプ以外に地雷や爆雷などのバリエーションが存在し、劇中で国連軍や戦略自衛隊が使徒に対して何度か使用しているのだ。旧東京にテロ攻撃によって落とされた新型爆弾をこれだとする説もある。威力は現在の戦略核兵器に匹敵し、地形が大きく変わってしまうほどである。核兵器とは違い放射能汚染を起こさないらしい（諸説あるが、N2とはNo Nuclearの略であるとされている）。
２００６年７月に公開された劇場映画「日本沈没」にもこの兵器が切り札として登場しているのだ。
インパクト・ボルト
F型装備の両肩に装備されている。ATフィールドによって発生させたエネルギーチャンバー内で増幅した高出力の指向性電撃を発射する。アニメ本編ではロボットアニメ的な必殺技が無かったevangelion eva01 ikari shinjiのために設定された兵装であり（ただし、スパロボシリーズではマゴロク・E・ソードが半ばeva01の必殺技的な演出となっていた）、『新世紀evangelion2』(PS２版、PSP版）、『第３次スーパーロボット大戦α』にeva01 ikari shinjiF型装備の最強の攻撃手段として登場する。
全領域兵器マステマ
プログナイフと同様に超振動により物体を分子レベルで切り裂くブレード、ガトリング砲、そして２発装備されているN2ミサイルを組み合わせた兵器。「全領域兵器」の名のとおり、近接、射撃、広域破壊に対応できる万能武器である。ゲーム『新世紀evangelion２』での新規兵装が初出。
名称の由来は、ユダヤ教の『出エジプト記』に登場する悪魔マステマなのだ。

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ロンギヌスの槍
死海より発見された巨大な槍なのだ。その形状は普段はらせん状に絡まっているが、状況によって形状を変化させることが可能であるのだ。長さはEVAの身長を軽く超えるため５０ｍほどだと思われる。A.T.フィールドを無効化するという絶大な威力を持つのだ。ターミナルドグマのririsuに突き刺されていたが、第２２話においてevangelion eva00が衛星軌道上の第１５使徒に対し使用した。なお、量産型が標準装備している剣はこの槍を基に造られたレプリカであるが、オリジナル同様にA.T.フィールドの無効化と形状変化は可能である。劇場版ではevangelion eva02がこのレプリカによってズタズタにされているのだ。
Eva専用改造陽電子砲Nerv仕様（ポジトロン・スナイパー・ライフル）
第５使徒ラミエル殲滅のためににNERVが筑波の戦自研から借用したものなのだ。第２２話でevangelion eva00が使用したものは、これをもとにNERVが独自に建造したものであるのだ。一度発射すると冷却や再充填、ヒューズの交換などで次弾発射まで結構な時間がかかるのだ。　
『evangelion新劇場版:序』では大出力型第２次試作自走４６０mm陽電子砲と改称され、デザインも変更されているのだ。
また必要電力は１億８千万kW（キロワット）で大規模な電力が必要で日本中の電力を全て集めることで実施したのだ。evangelion 新劇場版では東京電力が取材協力してる為かこう言った単位を採用している。

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evangelion eva00 eva01 eva02 eva03 ikari shinji ayanami rei asuka toujiの銃火器について

ハンドガン
第１６話「死に至る病、そして」でikari shinji eva01が使用。現実のデザートイーグルとよく似ているのだ。
パレットライフル
主にikari shinji eva01が頻繁に使用しているアサルトライフルのような銃である。電磁レールガンを利用して劣化ウラン弾を高速で撃ち出すことが可能。
『evangelion新劇場版:序』では「evangelion専用大口径209mm小銃 AU Assault Rifle Type MM-99」と名付けられているのだ。
スナイパーライフル
ayanami rei eva00が第１６話と第２３話で使用した。レリエルには上空のものは影だったため効果はなく、アルミサエル相手にも通用しなかった。セミオートマチックで連射可能なのだ。
ポジトロンライフル
陽電子（ポジトロン）が物質中の電子に衝突・消滅する力を利用した武器。第６話ではまだ試作段階だったため使用されず、後述のポジトロンスナイパーライフルが徴用された。第２２話でeva02が、成層圏の使徒を攻撃するための改良型を使用している。
ハンドバズーカ
第１９話でasuka eva02が使用した小型で取り回しのよいバズーカ砲。第１９話「男の戰い」でasuka eva02がゼルエルに対して使用したが効果はなかったのだ。
バズーカ
第１８話でasuka eva02が携行した大型のバズーカ砲。しかし、touji eva03(バルディエル)相手には使用されなかったため威力は分からないのだ。
EM-226evangelion専用携帯型回転式多砲身440mm機関砲（ガトリング砲）
『evangelion新劇場版:序』において、第５の使徒との戦いで用いられた。薬莢が排出されている事などから実在のガトリング砲と同様の原理で動作する物と推測されるのだ。

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マゴロク・エクスターミネート・ソード
とても大きいの日本刀状の刀でeva01が装備できる。「ニュータイプ」１９９６年月１号表紙の山下いくと画のイラストで描かれている。その格好よさや見栄えの良さのため立体造形物やゲームでは頻繁に登場し、山下が制作総指揮をつとめる『evangelion ANIMA』でもeva01F型装備の武器として登場した。ニュータイプ表紙にて発表された当初、鞘先端と柄先端は厳密には設定されていなかったが、カウンターソードなど、詳細に設定画が描き起こされているのだ。
名前のネタは孫六兼元から。マゴロックスの柄部分上部にある黒い扇状の部分にある「SEKI」のマーキングからもこれが伺える。
カウンターソード
PlayStation用ゲーム『スーパーロボット大戦α』に登場。脇差のような形をしているが刀身の根元上部に銃口がついており、柄にあたる部位に内蔵されたトリガーを引くことで発射可能。刃の峰の後ろに付いている白い円柱上の部分がマガジンとなっている。
元々はバンダイのプラモデルLMHGシリーズ『evangelion eva01　輸送台仕様』に前述のマゴロックスを付属させる際、バンダイ担当者から『設定画があるならぜひ欲しい』との要望により設定画が描き下ろされた。山下は当初鞘（ソードパレット）に収めて肩部ウェポンラック後部に装着するように考えていたが、１本では見栄えが悪いとのことで同時に設定が起こされ、マゴロックス共々付属された。
アクティブソード
セガから販売されていたセガサターン用ゲーム『新世紀evangelion 2nd Impression』内において使用できるeva01の接近戦用装備。見た目はマゴロックスそのものであり、おそらく前述のマゴロックスの名称が正式に設定される前であり、スタッフが独自に名称を設定したものだと思われる。
エヴォリアル・バスター
プログレッシブ・ダガー
従来のプログナイフを大型化し殺傷力を高めている。PlayStation2用ゲーム『新世紀エヴァンゲリオン2』『第3次スーパーロボット大戦α』、PSP用ゲーム『新世紀evangelion 2 造られしセカイ -another cases-』に登場し、F型装備に搭載される。
大型破砕兵器デュアルソー
チェーンソーが2つ繋がったような形状をした近接戦装備。敵を切るというよりも粉砕するように使う。PlayStation2用ゲーム『新世紀エヴァンゲリオン2』での新規武器として登場したのが初出。ゲームから漫画版に逆輸入され、kaoruの搭乗するeva02がアルミサエル戦で使用。しかし、アルミサエルに物理融合され逆にEVA弐号機が左足を切断される。
ビゼンオサフネ
新世紀evangelion ANIMAにてEVAeva02弐式が使う武器。マゴロク・E・ソードと似ていて表面にA.Tフィールドがコーティングされている。

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今日は武器について！！
もっとも多く戦闘で使われるのがプログレッシブ・ナイフと呼ばれる近接戦闘用武器なのだ。これはevaに標準装備されている武器でプログナイフと略されることが多い。コードネームはＰＫ－０１。
これはただのナイフではなく、その刃が高振動粒子で形成させているのだ。刃事態が高振動することにより接触した物質を分子レベルまで分解して切断するナイフ。第４使徒シャムシェル戦において追い詰められたikari shinjiが肩のウェポンラックから取り出し初めて戦闘で使用された。
この戦闘において、プログレッシブナイフによる使徒のコアを破壊できることから、使徒への有効性を示したのだ。これ以降その扱いやすさから使用頻度がもっとも高い武器としてevangelionの戦闘に使用されることになる。
eva02には新型のカッターナイフ形のナイフが装備されている。たとえその刃が折れても刃を押し出すことにより新たな刃を出すことが可能になった。カッターナイフと同じ仕組みなのだ。しかし、刃の替えがきく分強度はeva01のナイフよりは劣る。そのため劇場版では二回程で使用不可になっている。